Niestety nie w moim przypadku... Foldery owszem są, ale puste "Moje dokumenty" jak i "Pulpit" itp., gdzie można znaleźć prywatne pliki nie zawierają nic. Jeśli uda mi się skopiować to co potrzebne za pomocą Linux Live to robię format i czystą instalację Win10, powiedzcie mi jeszcze czy zostawić partycję w NTFS czy konwertować na GPT?

Zostaw partycję w NTFS, mniej "kłopotów".

Zrobiłem czystą instalację Win10 i jak wszystko gra, aktywował się również bez problemu. Pliki tak jak mówiłeś łatwiej i szybciej było skopiować z poziomu Linuxa. Może to i na lepsze, że instalacja jest czysta, pozbyłem się za jednym zamachem nadmiaru syfu na partycji systemowej
Chociaż nie ukrywam, że aktualizacja systemu nie powinna wprowadzać takiego zamieszania....